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第一、患者在亚临床感染，所以导致尖锐湿疣容易复发：男性朋友的亚临床上感染一般出现患者的阴部，并且体积非常小的无蒂疣，直径大小1－3毫米。另一种常见于阴茎、肛周，肉眼不能见，只能在显微镜下才能见到病变。临床治疗时，医生只能清除肉眼能看见的那部分疣组织，对于肉眼看不见的病变是无法清除的。经过一段时间，肉眼看不见的病变就发展为肉眼能见的疣组织。
第二、治疗好之后，被病毒再次的感染：因为尖锐湿疣具有传染能力，所有在性生活过程中，很容易传染给夫妻的另一方，而另一方是亚临床感染或病毒携带者，通过性生活又被传染上，导致复发感染。
第三、运用的治疗方法不佳，导致疾病治疗过程中，容易复发：好多人患上尖锐湿疣之后，都没有到正规的医院接受治疗，所以治疗的过程中，虽然表面症状消失了，就以为好了，实际上病毒携带者，时间不久，又复发了。少数病人由于性关系长期混乱，导致反复感染。
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