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大多数临床观察尖锐湿疣患者报告显示，尖锐湿疣的潜伏期通常是3个月左右，但其中也有最短的可在3-4周，但是最长是潜伏期患者可达8-12个月。一些学者认为，有些在产期感染的婴儿到2岁都没有出现外生殖器疣，但57%的婴儿在2岁的年龄诊断时患有乳头状瘤。曾也有1例患者在与尖锐湿疣患者进行性交，在两星期后就出现了阴道口患有尖锐湿疣，另一个男性患者与女性尖锐湿疣患者的性生活一年半后才出现症状。
此外，从调查结果进一步证实尖锐湿疣潜伏期为2个月左右。结果还表明，潜伏期之间的男性和女性不同，如女性潜伏期要比男性的要断，还观察到男性和女性患者的尖锐湿疣潜伏期和当地环境有明显的关系，如当地环境差，潮湿，从而患者的分泌物就会多，尖锐湿疣潜伏期短。
当过了尖锐湿疣潜伏期之后，尖锐湿疣症状就出现了，典型损害是初发损害为小而柔软的淡红色丘疹，针帽或米粒大。逐渐增大，且数量逐渐增多，成为乳头瘤样、菜花样、鸡冠样或蕈样的赘生物，表面高低不平，质地柔软，如不及时治疗，疣体将逐渐增大，有的成为大的菜花状，基底有蒂;有的彼此融合，成为大块状，淡灰色，表面成乳头瘤状，可以有糜烂、溃疡，有分泌物，因继发感染，可致恶臭。患者一般无自觉症状。
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