在男性，男性阴茎皮肤受压力大的部位最易发生，未作包皮环切的男性尤其如上如此，尖锐湿疣常见于冠状沟、包皮内侧、龟头、系带及尿道口，有时见于阴茎体及周围皮肤，但很少见于阴囊。肛周的损害可发生在男性同性恋者。同性恋者，发生于肛周、直肠，肛周湿疣多由肛门性交引起的。但也有少数人未发生过肛门性交，也患肛周尖锐湿疣，这主要是肛门直肠区域环境潮湿，适合HPV的生长繁殖。